Laboratorio de Genómica Microbiana

Combinamos métodos en microbiología, genómica, bioinformática y epidemiología para estudiar la evolución y transmisión de de diversos patógenos relevantes para la salud pública en el Perú.
Nuestras investigaciones pueden ayudar a mejorar el diseño de estrategias de salud pública para reducir contagios por estos patógenos en la población peruana.

Año de creación: 2017
Unidad de Gestión: Facultad de Ciencias y Filosofía Alberto Cazorla
Última actualización: Noviembre 2020

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Líneas de Investigación

Epidemiología genómica de patógenos humanos.
Estudios de microbiomas humanos y ambientales.
Optimización de métodos para secuenciamiento y análisis de genomas.

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Equipo de Trabajo

Coordinador

Pablo Tsukayama Cisneros
Doctor
Microbiología molecular

Pre-grado en Biología en UPCH (Perú), con estudios de doctorado en microbiología molecular en la Universidad de Washington en St. Louis (WUSTL, EEUU) y maestría en salúd públic por la Escuela de Medicina Tropical de Londres (LSHTM, Inglaterra). Más de 15 años de experiencia en investigación en enfermedades infecciosas (tuberculosis, leishmaniasis, malaria, enfermedades entéricas, etc). En la actualidad, tengo dos líneas de investigación: (1) el microbioma intestinal humano y su rol en el desarrollo de infecciones entéricas, y (2) epidemiología genómica de patógenos bacterianos, utilizando el secuenciamiento de siguiente generación (NGS) para determinar patrones de distribución y diseminación en comunidades y hospitales de Lima.

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Proyectos en Curso

202151: Sistema descentralizado de vigilancia genómica para evaluar transmisión y evolución de SARS-CoV-2 en Perú
202993: Diagnóstico de SARS-CoV-2 basado en secuenciamiento de siguiente generación (NGS)
203553: Asociación entre Tuberculosis-multidrogorresistente y el consumo de alcohol
203906: Perfil de resistencia a drogas en cepas de Mycobacterium tuberculosis en el distrito de San Juan de Lurigancho durante el periodo 2013 a 2017
103229: ESTUDIO GENÓMICO DE LA DIVERSIDAD Y TRANSMISIÓN DE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS EN EL DISTRITO DE MAYOR INCIDENCIA DE TB DEL PERÚ
103185: DESARROLLO DE UNA PLATAFORMA BIOINFORMÁTICA PARA FACILITAR EL ANÁLISIS GENÓMICO DE INFECCIONES RESISTENTES A ANTIBIÓTICOS EN HOSPITALES DEL PERÚ.