Laboratorio de Biología Computacional y Ciencias Ómicas

El Laboratorio de Biología Computacional y Ciencias Ómicas tiene como principal interés la comprensión de procesos biológicos asociados con el cáncer, la longevidad y senescencia a través de la interpretación de la big data multiómica y estructura 3D de proteínas. Investigamos la acción de péptidos anticancerígenos como mecanismo de resistencia al cáncer en animales silvestres, lo cual puede llevar a encontrar nuevas terapias anticancerígenas en humanos. Aplicamos algoritmos de minería, análisis e integración de datos ómicos (genómicos, transcriptómicos, metabolómicos, epigenómicos, proteómicos), valiéndonos de recursos bioinformáticos e Inteligencia Artificial, para generar patrones que permitan predecir un efecto o comportamiento a nivel molecular. Investigamos también la resiliencia al cambio climático de organismos vegetales a través del análisis de secuencias y estructuras 3D de especies adaptadas a stress térmico, sequía y otros factores ambientales. Colaboramos de forma transversal con grupos en distintas disciplinas y áreas de investigación. 

Equipo del Laboratorio de Biología Computacional y Ciencias Ómicas.
  • Dra. Claudia Machicado Rivero
    Coordinadora
  • Felipe Yon Torres
    Profesor ordinario
  • Marco Rivera Jacinto
    Investigador externo
  • Miguel Chavez Fumagalli
    Investigador externo
  • Livisú Pajares
    Asistente de investigación
  • Karen Vara
    Asistente de investigación
  • Dr. Felipe Yon
    Colaborador
  • Vilma Vise
    Tesista
  • Karen Vara
    Tesista
  • Jazmin Pucuhuaranga
    Tesista
  • Luz Gamez
    Tesista
  • Maria Sanchez
    Tesista
  • Katherin Lau
    Tesista
  • Jose María Morales
    Tesista
  • Elizabeth Paredes
    Tesista
  • Nieves Ccarhuas
    Tesista
  • Grace Benites
    Tesista
  • Fabrizio Oliveri
    Tesista
  • Luis La Chira
    Tesista
  • Abneer Vidaurre
    Tesista
  • Bryan Chero
    Tesista
  • Cristina Mendoza
    Tesista
  • Nazaira Montes
    Tesista
  • Maria Zevallos
    Tesista
  • Ricardo Rengifo
    Tesista
  • Gabriela Morón
    Tesista
  • Alonso Quispe
    Tesista
  • Universidad Católica de Santa María
    Dr. Miguel Chavez
  • Universidad Nacional de Cajamarca
    Dr. Marco Rivera
  • UPCH

Algunos proyectos de investigación

Proteínas nucleares de agentes infecciosos carcinogénicos

EN EJECUCIÓN

Kinasas y reposicionamiento de fármacos

EN EJECUCIÓN

Biodegradación de plásticos

EN EJECUCIÓN

Dianas de proteasas de Porphyromonas gingivalis y Treponema denticola en el tejido nervioso

EN EJECUCIÓN

Péptidos antimicrobianos de cocodrilo como agentes anticancerígenos

EN EJECUCIÓN

Aspectos moleculares de la longevidad

EN EJECUCIÓN

Resiliencia al cambio climático con aproximaciones bioinformáticas

EN EJECUCIÓN

Biorremedicación empleando especies vegetales acumuladoras de metales

EN EJECUCIÓN

Algunas publicaciones

+ E6AP goes viral: the role of E6AP in viral and non-viral related cancers

DOI: 20.500.1 2866/6774

+ Screening The Pathogen Box for Identification of New Chemicals Agents With Anti Fasciola hepatica Activity

DOI: 20.500.12866/6899

+ Negative serology of Fasciola hepatica infection in patients with liver cancer in Peru: a preliminary report 

DOI: 20.500.12866/4133

+ A Computational Assessment of the Biological Features of the Human Macrophage-Migration Inhibitory Factor-1 Ortholog in Parasites and its Affinity to Human CD74 Receptor

DOI: 20.500.12866/4842

+ Human papillomavirus-associated oropharyngeal cancer: prioritizing preventive policies in susceptible populations

DOI: 20.500.12866/4914

+ The relationship between Fascioliasis and liver cancer, fibrosis and cirrhosis: A Systematic Review

DOI: 10.1371/journal.pntd.0004962

+ Hypothetical Granulin-Like Molecule from Fasciola hepatica Recognized by Bioinformatics Analysis

DOI: 20.500.12866/5111

+ Carcinogenesis associated with parasites other than Schistosoma, Opisthorchis and Clonorchis: A Systematic Review.

DOI: 20.500.12866/5110

+ Identification of tumors in liver infected by Fasciola gigantica

DOI: v21_n2/pdf/a06v21n2.pd

+ Potential Protective Effect from COVID-19 Conferred by Altitude: A Longitudinal Analysis in Peru During Full Lockdown

DOI: 10.1089/ham.2020.0202

+ Hepatocellular carcinoma in Peru: A molecular description of an unconventional clinical presentation

DOI: 10.1016/j.rgmxen.2023.04.009

+ Autochthonous Peruvian Natural Plants as Potential SARS-CoV-2 Mpro Main Protease Inhibitors

DOI: 10.3390/ph16040585

+ Clinicopathological profile of patients with hepatobiliary cancers at two main referral hospitals in Lima, Peru

Rev Gastroenterol Peru. 2022 Jan-Mar;42(1):25-32

+ In silico prediction of secretory proteins of Opisthorchis viverrini, Clonorchis sinensis and Fasciola hepatica that target the host cell nucleus

DOI: 10.1016/j.heliyon.2021.e07204

Premios

Beca Tejada
Universidad Peruana Cayetano Heredia

Pedro Huerta – 2021

Beca Tejada
Universidad Peruana Cayetano Heredia

Andre Guerrero y Fresia Casas – 2020

Beca Tejada
Universidad Peruana Cayetano Heredia

Marianne Luyo – 2016

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Contacto

claudia.machicado.r@upch.pe