El Grupo Malaria-Epidemiología Molecular realiza investigación en epidemiología molecular del parásito que causa la malaria, utilizando herramientas moleculares y bioinformáticas para contribuir al desarrollo de nuevas estrategias para el control y futura eliminación de la malaria en la Amazonía Peruana. Con este fin, el laboratorio colabora en conjunto con entidades nacionales e internacionales. 

Los proyectos de investigación que se ejecutan en este laboratorio involucran estudios de vigilancia genómica de malaria en distintas comunidades de la Amazonía peruana, utilizando tecnologías moleculares de última generación (secuenciamiento de genoma completo y de nueva generación, WGS y NGS) y herramientas bioinformáticas. Todo ello nos permite evaluar la genética de poblaciones para determinar la distribución de las variantes de los parásitos, identificar marcadores moleculares de resistencia a antimaláricos y determinar la deleción de genes asociados a fallas con pruebas de diagnóstico rápido. Además, se realizan el desarrollo y validación de nuevos métodos de diagnóstico (en los puntos de atención) para la identificación de Plasmodium vivax y P. falciparum.