El Laboratorio de Ciencias del Mar realiza análisis de agua intersticial en sedimentos marinos, de fitoplancton, análisis de materia orgánica de sedimentos de zonas marino costeras, de restos silíceos en sedimentos, de foraminíferos bentónicos; así como de datos oceanográficos. Además, se hace la descripción de testigos sedimentarios, así como la descripción y análisis de la biota bentónica en general.

Su objetivo es generar conocimiento acerca de la calidad de hábitats marino-costeros, así como de la variabilidad de paleoambientes a través del tiempo en relación a las condiciones climáticas.